Para executar o garbage collector é necessário primeiro fazer o mesmo aparecer na sua tela do eclipse, para isso é necessário seguir alguns passos:
1. Na barra de menu do eclipse:
Window > Preferences > General
Agora que você já habilitou o heap status o mesmo poderá ser visto na parte inferior do seu eclispe.
Nesse icon é possível executar o garbage collector clicando no icone da lixeira e também é possível visualizar a memória utilizado / memória total.